RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478658.1

USF3-202, Transcript of upstream transcription factor family member 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene USF3, Length 8,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF3-202ENST00000478658 NPATQ14207 1427 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 WIZO95785 1651 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 LCHNA4D1U4 455 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 PDXKO00764 312 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 CIDEAO60543 219 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 DDCP20711 480 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 MAOBP27338 520 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 KCNJ5P48544 419 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 P2RX1P51575 399 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 IRF8Q02556 426 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 SLC10A1Q14973 349 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ACBD4Q8NC06 268 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 DIO2Q92813 273 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 MECRQ9BV79 373 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 CIPCQ9C0C6 399 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 OR11A1Q9GZK7 315 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 MMP27Q9H306 513 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 A0A0D9SG52 128 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 C9IYK1 514 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 E7EWF7 191 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TP53I11O14683 189 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 FOXO3O43524 673 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ALDH2P05091 517 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 AKR1C4P17516 323 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ACVR2AP27037 513 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ADH7P40394 386 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 KCNJ1P48048 391 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 GJA9P57773 515 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 FMO1Q01740 532 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 RASA2Q15283 850 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 RAB41Q5JT25 222 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 CNTN4Q8IWV2 1026 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 FBXO22Q8NEZ5 403 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 DCUN1D4Q92564 292 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 MYO19Q96H55 970 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 BMFQ96LC9 184 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 RAD9AQ99638 391 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 AP1M1Q9BXS5 423 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ASAH2Q9NR71 780 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ZNF225Q9UK10 706 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 GRIN2AQ12879 1464 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 DVL1O14640 695 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TSPAN3O60637 253 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 C2P06681 752 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 UCHL1P09936 223 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 CRATP43155 626 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 NDST1P52848 882 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TAS2R20P59543 309 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 MCL1Q07820 350 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 GNASQ5JWF2 1037 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 C14orf80Q86SX3 495 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 TAS1R2Q8TE23 839 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 IL22Q9GZX6 179 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 CWH43Q9H720 699 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 SCDO00767 359 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 RAMP2O60895 175 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 PAGE1O75459 146 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 HMGN1P05114 100 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 ADH1AP07327 375 aa5.35□□□□□ -1.55
USF3-202ENST00000478658 HBQ1P09105 142 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms