RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa13.66□□□□□ -0.22
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SRRT-210ENST00000477529 ZNF549Q6P9A3 640 aa13.66□□□□□ -0.22
SRRT-210ENST00000477529 UNC5DQ6UXZ4 953 aa13.66□□□□□ -0.22
SRRT-210ENST00000477529 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.66□□□□□ -0.22
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SRRT-210ENST00000477529 DTX1Q86Y01 620 aa13.66□□□□□ -0.22
SRRT-210ENST00000477529 CNTN4Q8IWV2 1026 aa13.66□□□□□ -0.22
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SRRT-210ENST00000477529 KMT5CQ86Y97 462 aa13.65□□□□□ -0.22
SRRT-210ENST00000477529 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa13.65□□□□□ -0.22
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SRRT-210ENST00000477529 ZBTB2Q8N680 514 aa13.65□□□□□ -0.22
SRRT-210ENST00000477529 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SRRT-210ENST00000477529 CFAP61Q8NHU2 1237 aa13.65□□□□□ -0.22
SRRT-210ENST00000477529 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa13.65□□□□□ -0.22
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SRRT-210ENST00000477529 OR6C1Q96RD1 312 aa13.65□□□□□ -0.22
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SRRT-210ENST00000477529 PITPNM3Q9BZ71 974 aa13.65□□□□□ -0.22
SRRT-210ENST00000477529 DPH5Q9H2P9 285 aa13.65□□□□□ -0.22
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SRRT-210ENST00000477529 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.65□□□□□ -0.22
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SRRT-210ENST00000477529 E5RI56 91 aa13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 NDC80O14777 642 aa13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 HAUS5O94927 633 aa13.64□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 RPN2P04844 631 aa13.64□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 BROXQ5VW32 411 aa13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 DUPD1Q68J44 220 aa13.64□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 CNSTQ6PJW8 725 aa13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 ANKMY2Q8IV38 441 aa13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 D2HGDHQ8N465 521 aa13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 KCNJ9Q92806 393 aa13.64□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa13.64□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 PCSK5Q92824 1860 aa13.63□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 PIPSLA2A3N6 862 aa13.63□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 C2orf74A8MZ97 194 aa13.63□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 URI1O94763 535 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 MATN4O95460 622 aa13.63□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 DLGAP3O95886 979 aa13.63□□□□□ -0.23
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