RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 COCHO43405 550 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 JAK2O60674 1132 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 KLKB1P03952 638 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 SERPINA6P08185 405 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 SPARCP09486 303 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 ADH6P28332 368 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 AP1S2P56377 157 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 PEX3P56589 373 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 ALCAMQ13740 583 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 SGCBQ16585 318 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 TOR2AQ5JU69 321 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 MLIPQ5VWP3 458 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 CARD17Q5XLA6 110 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 RFWD3Q6PCD5 774 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 OR2L3Q8NG85 312 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 RSC1A1Q92681 617 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 PANK4Q9NVE7 773 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 P4HTMQ9NXG6 502 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 RAB23Q9ULC3 237 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 BPTFQ12830 3046 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-208ENST00000474246 CEP250Q9BV73 2442 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MYO9BQ13459 2157 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 OR14I1A6ND48 311 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC53A6NM62 1247 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SNAP23O00161 211 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 AQP7O14520 342 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MDM4O15151 490 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 UGDHO60701 494 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 OR6B1O95007 311 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MCF2P10911 925 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 GFAPP14136 432 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MSR1P21757 451 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TACR3P29371 465 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 BSGP35613 385 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 NUDT1P36639 197 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 IDH3AP50213 366 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 IST1P53990 364 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 RESTQ13127 1097 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PPP1R3AQ16821 1122 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF667Q5HYK9 610 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 LIPNQ5VXI9 398 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SPOPLQ6IQ16 392 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ADCK2Q7Z695 626 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 BATF2Q8N1L9 274 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF786Q8N393 782 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CFHR4Q92496 578 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 LPGAT1Q92604 370 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PHF21AQ96BD5 680 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CYP2S1Q96SQ9 504 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CITED1Q99966 193 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 UBXN6Q9BZV1 441 aa5.96□□□□□ -1.46
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