RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 KIAA0754O94854 1291 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 TIAF1O95411 115 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PVRP15151 417 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ACY1Q03154 408 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CTBP1Q13363 440 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 GPR19Q15760 415 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 LONRF1Q17RB8 773 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 MSS51Q4VC12 460 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 UNC5BQ8IZJ1 945 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 GSDMBQ8TAX9 411 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 FGF21Q9NSA1 209 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa28.38■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PIPSLA2A3N6 862 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 KPNA5O15131 536 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 S1PR4O95977 384 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ESR1P03372 595 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ST6GAL1P15907 406 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 BBS9Q3SYG4 887 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM73Q86UV7 250 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CARFQ8N187 725 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 GALNT6Q8NCL4 622 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PWWP2AQ96N64 755 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 KRT12Q99456 494 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM31Q9BZY9 425 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SPHK1Q9NYA1 384 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 GALPQ9UBC7 116 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 RNF14Q9UBS8 474 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 BTRCQ9Y297 605 aa28.37■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ATMQ13315 3056 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PKMP14618 531 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PGAM1P18669 254 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CHRM3P20309 590 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CASQ1P31415 396 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ADARP55265 1226 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 TMTC4Q5T4D3 741 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CYB5D1Q6P9G0 228 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 UNC5DQ6UXZ4 953 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 NFS1Q9Y697 457 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 FAM169AQ9Y6X4 670 aa28.36■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 H3BMM5 538 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 UGT2B7P16662 529 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SLC1A2P43004 574 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CYP4F2P78329 520 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 RHDQ02161 417 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CRYMQ14894 314 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SPESP1Q6UW49 350 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SYT10Q6XYQ8 523 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PITPNM3Q9BZ71 974 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa28.35■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 E5RI56 91 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 KDM1AO60341 852 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 RPN2P04844 631 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 TUBB4BP68371 445 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 MPP1Q00013 466 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 TUBB2AQ13885 445 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 MORF4L2Q15014 288 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 CNSTQ6PJW8 725 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 KCNMB4Q86W47 210 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 IGDCC3Q8IVU1 814 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SPNS2Q8IVW8 549 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ESX1Q8N693 406 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 IL17FQ96PD4 163 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 OR2A14Q96R47 310 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 TUBB2BQ9BVA1 445 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 OR6C2Q9NZP2 312 aa28.34■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 SPTBP11277 2137 aa28.33■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 PKLRP30613 574 aa28.33■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 BDKRB1P46663 353 aa28.33■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ITGA8P53708 1063 aa28.33■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ETF1P62495 437 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 ABHD18Q0P651 414 aa28.33■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 MAP7Q14244 749 aa28.33■■■□□ 2.13
FBXO18-208ENST00000470089 GRB7Q14451 532 aa28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms