RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF23	P17027	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC5A2	P31639	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SFN	P31947	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MAGEA6	P43360	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ATP5O	P48047	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ACADVL	P49748	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LIG4	P49917	911 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HSD17B4	P51659	736 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NUP107	P57740	925 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	IGBP1	P78318	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	COG7	P83436	770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TCP10	Q12799	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MTA1	Q13330	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NAB1	Q13506	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TRPC3	Q13507	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TFDP2	Q14188	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	UGCG	Q16739	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MCU	Q8NE86	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CIT	O14578	2027 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		H7C4K7	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC22A2	O15244	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MED7	O43513	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	UGT1A9	O60656	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PLIN3	O60664	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ENTPD3	O75355	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LRCH4	O75427	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TOMM40	O96008	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PIGR	P01833	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CTSA	P10619	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	THRA	P10827	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	KRT3	P12035	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GYS1	P13807	737 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMC3	P17980	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms