RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 TPBGLP0DKB5 382 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PAFAH1B1P43034 410 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 TUBB4BP68371 445 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 TUBB2AQ13885 445 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 GPR19Q15760 415 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 IZUMO3Q5VZ72 239 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF470Q6ECI4 717 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PCGF5Q86SE9 256 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 HOOK3Q86VS8 718 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 CILP2Q8IUL8 1156 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SLC39A7Q92504 469 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 TTC9Q92623 222 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 MAP3K7O43318 606 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 USP1O94782 785 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 DR1Q01658 176 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 UNC5DQ6UXZ4 953 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 CENPUQ71F23 418 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 FCRL4Q96PJ5 515 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 EFHD1Q9BUP0 239 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 OR6C2Q9NZP2 312 aa23.22■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ATMQ13315 3056 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 NIPSNAP2O75323 286 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 TIAF1O95411 115 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ST6GAL1P15907 406 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 STAT5AP42229 794 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ADARP55265 1226 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 CYP4F2P78329 520 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 LONRF1Q17RB8 773 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 SPESP1Q6UW49 350 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 PCSK4Q6UW60 755 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 OR8K5Q8NH50 307 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 WBP1Q96G27 269 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL25Q9H0H3 589 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 KCND1Q9NSA2 647 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 RNF14Q9UBS8 474 aa23.21■■□□□ 1.31
SMKR1-201ENST00000462322 ATRXP46100 2492 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC188H7C350 402 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 TK2O00142 265 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 S1PR4O95977 384 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 CCNYL3P0C7X3 344 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 PKMP14618 531 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 PVRP15151 417 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 UGT2B7P16662 529 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 CHRM3P20309 590 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF789Q5FWF6 425 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 FAM136AQ96C01 138 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 SLC12A9Q9BXP2 914 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 FANCEQ9HB96 536 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 SPHK1Q9NYA1 384 aa23.2■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 FANCGO15287 622 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 MT-ND3P03897 115 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 PGAM1P18669 254 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 IVDP26440 423 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 PKLRP30613 574 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 RAB28P51157 221 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 CTBP1Q13363 440 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 KYNUQ16719 465 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 TTC23LQ6PF05 361 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM73Q86UV7 250 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM126BQ8IUX1 230 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 DENND6AQ8IWF6 608 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 CALML6Q8TD86 181 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 SLC45A3Q96JT2 553 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 OR2A14Q96R47 310 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 CIDEBQ9UHD4 219 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 IL17BQ9UHF5 180 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 PADI1Q9ULC6 663 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.19■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 ISM1B1AKI9 464 aa23.18■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 E5RI56 91 aa23.18■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 NTRK1P04629 796 aa23.18■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 SLC1A2P43004 574 aa23.18■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.18■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SMKR1-201ENST00000462322 FOPNLQ96NB1 174 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms