RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.93■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 PVRP15151 417 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 DLSTP36957 453 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 CTSL3PQ5NE16 218 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 SPESP1Q6UW49 350 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 OR8K5Q8NH50 307 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 BIRC8Q96P09 236 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 PIPSLA2A3N6 862 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 MT-ND3P03897 115 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 NTRK1P04629 796 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 FAM87AP0C7U9 286 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 PANX3Q96QZ0 392 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 PADI1Q9ULC6 663 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 CDC20Q12834 499 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 ABRQ12979 859 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 OR2A14Q96R47 310 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 TCF12Q99081 682 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 SCRG1O75711 98 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 MSL3P1P0C860 447 aa22.9■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 MC1RQ01726 317 aa22.89■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.89■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 TMEM135Q86UB9 458 aa22.89■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa22.89■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.89■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 KDM1AO60341 852 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-202ENST00000460160 RPN2P04844 631 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-202ENST00000460160 TCN2P20062 427 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-202ENST00000460160 RAB28P51157 221 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-202ENST00000460160 ADARP55265 1226 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-202ENST00000460160 DNASE1L3Q13609 305 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-202ENST00000460160 GRB7Q14451 532 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R7Q15435 360 aa22.88■■□□□ 1.25
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