RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 APOEP02649 317 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 LTFP02788 710 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 OCM2P0CE71 109 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 COL6A2P12110 1019 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ADRB3P13945 408 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 BPIP17213 487 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TACR2P21452 398 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 HTR1BP28222 390 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ALDH4A1P30038 563 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TTKP33981 857 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TSPAN7P41732 249 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 STAT5AP42229 794 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CPA2P48052 419 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ENTPD1P49961 510 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 LIMK2P53671 638 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 OR1D5P58170 312 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 NAA20P61599 178 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ENPEPQ07075 957 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CETN1Q12798 172 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 MOGQ16653 247 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 LGI2Q8N0V4 545 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 RTP4Q96DX8 246 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 C19orf60Q96EN9 201 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 APOPT1Q96IL0 206 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 RANBP9Q96S59 729 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CTRCQ99895 268 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ZPBPQ9BS86 351 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 GBA3Q9H227 469 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 PARVBQ9HBI1 364 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ACSS2Q9NR19 701 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CISHQ9NSE2 258 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 SELENONQ9NZV5 590 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ARMCX1Q9P291 453 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 COPG2Q9UBF2 871 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 IL36AQ9UHA7 158 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 VPS28Q9UK41 221 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 PIPSLA2A3N6 862 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 WDR91A4D1P6 747 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 F5H5T6 163 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 PFDN6O15212 129 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ZG16O60844 167 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 SULT1C4O75897 302 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 FBXO21O94952 628 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TNFP01375 233 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 INHBBP09529 407 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 FURINP09958 794 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 RBP3P10745 1247 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CAPN3P20807 821 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 BGNP21810 368 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CDH3P22223 829 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 MPSTP25325 297 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 IGFALSP35858 605 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 GCLMP48507 274 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CCL11P51671 97 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 VAMP7P51809 220 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 GPX6P59796 221 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ARPC4P59998 168 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 B4GALNT1Q00973 533 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 SEMA5AQ13591 1074 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 DPYSQ14117 519 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CHRNA6Q15825 494 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 CNGA3Q16281 694 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC6-210ENST00000441703 ZBED5Q49AG3 693 aa6.34□□□□□ -1.39
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