RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SPINT2O43291 252 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 UGDHO60701 494 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PEX11BO96011 259 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 AK1P00568 194 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PGK2P07205 417 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 HKR1P10072 659 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SFTPCP11686 197 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MPZP25189 248 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX6P35712 828 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEB1P43366 347 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPK12P53778 367 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH12P55289 794 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MTCP1P56278 107 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CETN1Q12798 172 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CUL3Q13618 768 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ICAM4Q14773 271 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CEBPEQ15744 281 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 EPC2Q52LR7 807 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 DLK2Q6UY11 383 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MACC1Q6ZN28 852 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 BEST3Q8N1M1 668 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TEX45Q8NA69 505 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM185AQ8NFB2 350 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF398Q8TD17 642 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ORAI1Q96D31 301 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 EPSTI1Q96J88 318 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 RITA1Q96K30 269 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 COQ10AQ96MF6 247 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ERP44Q9BS26 406 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CARD6Q9BX69 1037 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CARD9Q9H257 536 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ECT2Q9H8V3 914 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEF1Q9HAY2 307 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH20Q9HBT6 801 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CPNE5Q9HCH3 593 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAMTS20P59510 1910 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 STMND1H3BQB6 276 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 HS3ST1O14792 307 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNN4O15554 427 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 GMFGO60234 142 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT6BP04259 564 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SKILP12757 684 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 UGT1A1P22309 533 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 AVPR1AP37288 418 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MPLP40238 635 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT6CP48668 564 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ST3GAL1Q11201 340 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 STXBP2Q15833 593 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 DECR1Q16698 335 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ARMCX2Q7L311 632 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 AMZ2Q86W34 360 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD46Q86W74 232 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC5CLQ8IV45 518 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 DSELQ8IZU8 1212 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 IL17DQ8TAD2 202 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FIG4Q92562 907 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TAAR8Q969N4 342 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPYL1Q9H0U9 437 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 NAPBQ9H115 298 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM245Q9H330 911 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SNX25Q9H3E2 840 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.51□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 HHATLQ9HCP6 504 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms