RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NEMP2A6NFY4 417 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR6C75A6NL08 312 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF103O00237 685 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLK4O00444 970 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SOCS6O14544 535 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPRY3O43610 288 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEC22BO75396 215 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RFPL2O75678 378 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 B3GALNT1O75752 331 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SERPINI2O75830 405 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C8orf89P0DMQ9 161 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DESP17661 470 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC6A6P31641 620 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CTNNB1P35222 781 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AMTP48728 403 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLDN20P56880 219 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CUL3Q13618 768 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPS6KA1Q15418 735 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRNP1Q6NT89 227 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q6ZTC4 211 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCTD9Q7L273 389 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRAG1Q86YV5 1406 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LPCAT1Q8NF37 534 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NCOA7Q8NI08 942 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC107Q8WV48 283 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ASB5Q8WWX0 329 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMPDL3BQ92485 455 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CENPTQ96BT3 561 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TXNDC15Q96J42 360 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DPAGT1Q9H3H5 408 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNIH4Q9P003 139 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACEP12821 1306 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PPW3 197 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 hDV102S1A0JD36 115 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM221A6NGB7 291 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRR32B1ATL7 298 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM86B1E9PN63 330 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 H0YGN5 161 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 I6L893 689 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 J3KR12 359 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AP5Z1O43299 807 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR137BO60478 399 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GH1P01241 217 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NGFRP08138 427 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GAP43P17677 238 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RGS7P49802 495 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD81P60033 236 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNK1Q13470 666 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCTE1Q5JU00 501 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLC3Q6P597 504 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM270Q6UE05 265 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUP54Q7Z3B4 507 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC26A7Q8TE54 656 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TAF4BQ92750 862 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIGTQ969N2 578 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR1F2PQ96R84 312 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CMKLR1Q99788 373 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C1orf21Q9H246 121 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANO10Q9NW15 660 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RHCGQ9UBD6 479 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A0U1RQJ8 604 aa4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PP11 408 aa4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BMP10O95393 424 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms