RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NAT6	Q93015	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055		H3BQV1	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CNTN5	O94779	1100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CD58	P19256	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CASP4	P49662	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC8A3	P57103	927 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CCL7	P80098	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NUCB2	P80303	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	C1orf61	Q13536	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CUL4B	Q13620	913 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CCNI	Q14094	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	E2F2	Q14209	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CSHL1	Q14406	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PSMD6	Q15008	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	BAK1	Q16611	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	MED25	Q71SY5	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055		D6RAR5	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055		E7EVH7	732 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SPTLC2	O15270	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC7A4	O43246	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RGS10	O43665	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	EXOC3	O60645	756 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	USP1	O94782	785 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RASAL1	O95294	804 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PEX11B	O96011	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CSF2	P04141	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CD19	P15391	556 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NR1D1	P20393	614 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ITGAL	P20701	1170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CHM	P24386	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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