RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410466.1

RNU6-554P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 554, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-554P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-554P-201ENST00000410466 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 DGAT2Q96PD7 388 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 CCDC28BQ9BUN5 200 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 OCR1Q9BZK8 76 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 OR14J1Q9UGF5 321 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0□□□□□ -2.41
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RNU6-554P-201ENST00000410466 G3V2L1 256 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 H0Y3Z8 333 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 K7EQD1 137 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ANP32CO43423 234 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 QDPRP09417 244 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ACP2P11117 423 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ALDH1B1P30837 517 aa-0.01□□□□□ -2.41
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RNU6-554P-201ENST00000410466 SPARCL1Q14515 664 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 NAA25Q14CX7 972 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 C9orf66Q5T8R8 295 aa-0.01□□□□□ -2.41
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RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC38A9Q8NBW4 561 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 C11orf65Q8NCR3 313 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ITLN1Q8WWA0 313 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 EID2BQ96D98 161 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 PPP1R16AQ96I34 528 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 C2orf48Q96LS8 159 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 IMMP1LQ96LU5 166 aa-0.01□□□□□ -2.41
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RNU6-554P-201ENST00000410466 TMEM47Q9BQJ4 181 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 G6PC2Q9NQR9 355 aa-0.01□□□□□ -2.41
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RNU6-554P-201ENST00000410466 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 CAPN7Q9Y6W3 813 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ASTN1O14525 1302 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 UTYO14607 1347 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 SNAI2O43623 268 aa-0.02□□□□□ -2.41
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RNU6-554P-201ENST00000410466 OR1L3Q8NH93 324 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 SPPL2AQ8TCT8 520 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 GTSF1Q8WW33 167 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
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RNU6-554P-201ENST00000410466 A4GALTQ9NPC4 353 aa-0.02□□□□□ -2.41
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RNU6-554P-201ENST00000410466 RSPH14Q9UHP6 348 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 GDAQ9Y2T3 454 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF541Q9H0D2 1346 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 OR2M5A3KFT3 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 PHGR1C9JFL3 82 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 PDHXO00330 501 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ACKR2O00590 384 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZBTB43O43298 467 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 VENTXO95231 258 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 KCNK5O95279 499 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 GALTP07902 379 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 GP1BBP13224 206 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 AOC1P19801 751 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 FASP25445 335 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 SUOXP51687 545 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-554P-201ENST00000410466 LBX1P52954 281 aa-0.03□□□□□ -2.41
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