RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRAME-204ENST00000403441 GPR33Q49SQ1 333 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.93□□□□□ -0.5
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