RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 CLIC1O00299 241 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNDBP1O95273 360 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TNNI3P19429 210 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ABHD18Q0P651 414 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TIGD6Q17RP2 521 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC15A3Q8IY34 581 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 MINDY1Q8N5J2 469 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 B3GALT6Q96L58 329 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TOR3AQ9H497 397 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKFN1Q8N957 763 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 NANOGQ9H9S0 305 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TP73O15350 636 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 IL7RP16871 459 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TMBIM6P55061 237 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF778Q96MU6 729 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ACLYP53396 1101 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SNAPC1Q16533 368 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SYT16Q17RD7 645 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TUBA1CQ9BQE3 449 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC30A4O14863 429 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 CREG1O75629 220 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 AP2A2O94973 939 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 RASAL1O95294 804 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SDC2P34741 201 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SSR2P43308 183 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R41P59536 307 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 FIBCD1Q8N539 461 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 UXS1Q8NBZ7 420 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 BIRC8Q96P09 236 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 CFL2Q9Y281 166 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 FPR1P21462 350 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIK2Q13002 908 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNA10Q16322 511 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 MUS81Q96NY9 551 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC32A1Q9H598 525 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 AMBNQ9NP70 447 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2AG2A6NM03 316 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 H0Y858 1186 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 STBD1O95210 358 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 GADD45GO95257 159 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 GLDCP23378 1020 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TGFBIQ15582 683 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 MEP1AQ16819 746 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNJ9Q92806 393 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SORT1Q99523 831 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 CACNA1SQ13698 1873 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0U1RQF3 1178 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 MTAPQ13126 283 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB39AQ14964 217 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 UNC50Q53HI1 259 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 CACUL1Q86Y37 369 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KDM1BQ8NB78 822 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 PYURFQ96I23 114 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 BEST1O76090 585 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SNAP29O95721 258 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ADH1AP07327 375 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 POU2F1P14859 743 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms