RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 VPS11Q9H270 941 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 NMRAL1Q9HBL8 299 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 ARHGEF33A8MVX0 844 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 MT-ND3P03897 115 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 CD1DP15813 335 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 CYP2A7P20853 494 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM83EQ2M2I3 478 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 KRT71Q3SY84 523 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 PERM1Q5SV97 790 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 CYP4X1Q8N118 509 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 OR52E1Q8NGJ3 308 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 MCOLN3Q8TDD5 553 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC3Q9BQI4 270 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 PARVBQ9HBI1 364 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 KCNK4Q9NYG8 393 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC189A1A4V9 331 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 ALDH4A1P30038 563 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 GPLD1P80108 840 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 PLCL1Q15111 1095 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 SPRED1Q7Z699 444 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 RP1P56715 2156 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 BTN3A1O00481 513 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 KLHL2O95198 593 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 CDK4P11802 303 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 BDKRB1P46663 353 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 CEP85LQ5SZL2 805 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 HDXQ7Z353 690 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 SPATA6LQ8N4H0 392 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 LCN9Q8WX39 176 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 TRIM54Q9BYV2 358 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 IGSF5Q9NSI5 407 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM221BA6H8Z2 402 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 HIST1H2ADP20671 130 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 IRF9Q00978 393 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 E2F1Q01094 437 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 GRB7Q14451 532 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 KLHL35Q6PF15 583 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 LCA5Q86VQ0 697 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 RAB42Q8N4Z0 105 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 OR9A1PQ8NGU1 263 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 OR10G6Q8NH81 332 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 KCTD4Q8WVF5 259 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 DLG3Q92796 817 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 HIST1H2AJQ99878 128 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 H2AFJQ9BTM1 129 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 MYO1CO00159 1063 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 CDC7O00311 574 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 B4GAT1O43505 415 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 RFPL3O75679 317 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 SHMT2P34897 504 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 OR1D5P58170 312 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 DLG1Q12959 904 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 KLC3Q6P597 504 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 SBSNQ6UWP8 590 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 WDR48Q8TAF3 677 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 KIAA1191Q96A73 305 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 NXNL1Q96CM4 212 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 TSNARE1Q96NA8 513 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 TOR4AQ9NXH8 423 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 IKZF3Q9UKT9 509 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 PDE10AQ9Y233 779 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 DMXL1Q9Y485 3027 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 A0A1W2PPM1 405 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 UBXN7O94888 489 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 RAB28P51157 221 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 AP1S2P56377 157 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 SQSTM1Q13501 440 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 ACAP2Q15057 778 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 TSNQ15631 228 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 CLEC14AQ86T13 490 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 AMIGO1Q86WK6 493 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 RUFY1Q96T51 708 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 SRMSQ9H3Y6 488 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 PCMTD2Q9NV79 361 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 DLL3Q9NYJ7 618 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 SPATA7Q9P0W8 599 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC22A23-201ENST00000380298 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms