RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 CLHC1Q8NHS4 586 aa24.77■■□□□ 1.56
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C9orf40-201ENST00000376854 C1orf109Q9NX04 203 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf40-201ENST00000376854 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf40-201ENST00000376854 PDE10AQ9Y233 779 aa24.75■■□□□ 1.55
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C9orf40-201ENST00000376854 KCNAB2Q13303 367 aa24.74■■□□□ 1.55
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C9orf40-201ENST00000376854 ZNF554Q86TJ5 538 aa24.74■■□□□ 1.55
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C9orf40-201ENST00000376854 AP3M1Q9Y2T2 418 aa24.74■■□□□ 1.55
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C9orf40-201ENST00000376854 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf40-201ENST00000376854 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf40-201ENST00000376854 CREG1O75629 220 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf40-201ENST00000376854 TRBC1P01850 177 aa24.73■■□□□ 1.55
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C9orf40-201ENST00000376854 EID3Q8N140 333 aa24.73■■□□□ 1.55
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C9orf40-201ENST00000376854 ZBTB46Q86UZ6 589 aa24.73■■□□□ 1.55
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C9orf40-201ENST00000376854 BLOC1S6Q9UL45 172 aa24.73■■□□□ 1.55
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C9orf40-201ENST00000376854 FAM220BPB1ANY3 271 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf40-201ENST00000376854 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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