RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 TM7SF2O76062 418 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 AP2A1O95782 977 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 OPN1SWP03999 348 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 IFNW1P05000 195 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ECH1Q13011 328 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GPR153Q6NV75 609 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 AKAP14Q86UN6 197 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 LHX5Q9H2C1 402 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PDPK1O15530 556 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 OR4C6Q8NH72 309 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MAP2K7O14733 419 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ANGPTL1O95841 491 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TAS2R50P59544 299 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PPP3R1P63098 170 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 LRRC32Q14392 662 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC32A1Q9H598 525 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF823P16415 610 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC1A2P43004 574 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ANKFN1Q8N957 763 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TNFRSF25Q93038 417 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CENPMQ9NSP4 180 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF358Q9NW07 568 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM51Q9NW97 253 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FZD10Q9ULW2 581 aa14.47□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CARNS1A5YM72 827 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 B4GALT4O60513 344 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PGAM2P15259 253 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ACADLP28330 430 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CCKBRP32239 447 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 IDH3AP50213 366 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMC8Q8IU68 726 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PIGXQ8TBF5 258 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TIFAQ96CG3 184 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SCGB1D2O95969 90 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 BDKRB1P46663 353 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ADGRE1Q14246 886 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 VSTM1Q6UX27 236 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM13CQ8NE31 585 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 GGT5P36269 586 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ACTR1BP42025 376 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ACTR1AP61163 376 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TXNDC8Q6A555 127 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 USP30Q70CQ3 517 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 S100ZQ8WXG8 99 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 CCDC120Q96HB5 630 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 IL36AQ9UHA7 158 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 A0A1W2PQ72 361 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NEMP2A6NFY4 417 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 NDUFS4O43181 175 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TSPAN9O75954 239 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF806P0C7X5 589 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TNFRSF8P28908 595 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ACTR3P61158 418 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM203Q969S6 136 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 SNX27Q96L92 541 aa14.46□□□□□ -0.09
NOTCH4-201ENST00000375023 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 MID1O15344 667 aa14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 NIPSNAP2O75323 286 aa14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 CH25HO95992 272 aa14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 THRBP10828 461 aa14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 NUS1Q96E22 293 aa14.46□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 CLUHO75153 1309 aa14.45□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.45□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 GADD45GO95257 159 aa14.45□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 HMGCS1Q01581 520 aa14.45□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.45□□□□□ -0.1
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms