RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 H3BM21 787 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 CASKO14936 926 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 MVKQ03426 396 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 SGCGQ13326 291 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 CTC1Q2NKJ3 1217 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 TYSND1Q2T9J0 566 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 NEK10Q6ZWH5 1172 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 DUSP26Q9BV47 211 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 SEC14L3Q9UDX4 400 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 POU2F1P14859 743 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 NIPAL1Q6NVV3 410 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 CENPSQ8N2Z9 138 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 MINDY1Q8N5J2 469 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF347Q96SE7 839 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 TRIM8Q9BZR9 551 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 SEMA3GQ9NS98 782 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 ASB3Q9Y575 518 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 PFKMP08237 780 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 TMBIM6P55061 237 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRU-202ENST00000373779 TAF1P21675 1872 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ARAP2Q8WZ64 1704 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PRORSD1PA6NEY8 169 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 OR2AG2A6NM03 316 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 MAFKO60675 156 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CREG1O75629 220 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 BNC1Q01954 994 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 UGT2A3Q6UWM9 527 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 AP2A2O94973 939 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PGRP06401 933 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 IQCF3P0C7M6 154 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PRPS1L1P21108 318 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 FLT3LGP49771 235 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 AGTR2P50052 363 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 IL18R1Q13478 541 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 TAZQ16635 292 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 KLHL12Q53G59 568 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 VN1R5Q7Z5H4 357 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 RHEBL1Q8TAI7 183 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PYURFQ96I23 114 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SMURF2Q9HAU4 748 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 BCORQ6W2J9 1755 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ILVBLA1L0T0 632 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CCNYL3P0C7X3 344 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 COLEC12Q5KU26 742 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CACUL1Q86Y37 369 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 RDH12Q96NR8 316 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 RANBP9Q96S59 729 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 TUBA1CQ9BQE3 449 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SMOXQ9NWM0 555 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ING3Q9NXR8 418 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CLIC1O00299 241 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 HPGDP15428 266 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 DCST1Q5T197 706 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 NAT16Q8N8M0 369 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 KDM1BQ8NB78 822 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 KCNS3Q9BQ31 491 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 FAM83DQ9H4H8 585 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 EXD2Q9NVH0 621 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 AP3D1O14617 1153 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PRAMEF11O60813 436 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 XYLBO75191 536 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 WBP4O75554 376 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 S1PR4O95977 384 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ARL4DP49703 201 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 TGFBIQ15582 683 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 C6orf136Q5SQH8 315 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PLET1Q6UQ28 207 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 DIRAS2Q96HU8 199 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CCSER2Q9H7U1 834 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 A0A1W2PQ67 120 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CCNDBP1O95273 360 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 TNNI3P19429 210 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CD68P34810 354 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 TAS2R41P59536 307 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SERINC3Q13530 473 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SYT16Q17RD7 645 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 GOLM1Q8NBJ4 401 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 COL26A1Q96A83 441 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SLC29A3Q9BZD2 475 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 DCSTAMPQ9H295 470 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PRDM8Q9NQV8 689 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms