RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TKTL2Q9H0I9 626 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 MAGEE1Q9HCI5 957 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 PDRG1Q9NUG6 133 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TMEM161AQ9NX61 479 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 DUSP12Q9UNI6 340 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 KMT2EQ8IZD2 1858 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 A0A096LPK6 155 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ANXA2P2A6NMY6 339 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 HSPB2A8KAH6 182 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ZBTB14O43829 449 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 TMCC1O94876 653 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 CD63P08962 238 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 DESP17661 470 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ACADLP28330 430 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 GRIA3P42263 894 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 PRCPP42785 496 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 GPR12P47775 334 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 MGAT3Q09327 533 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 KLF10Q13118 480 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 FHL2Q14192 279 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ALX1Q15699 326 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 HSPB2Q16082 182 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 C6orf163Q5TEZ5 329 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 MFN1Q8IWA4 741 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 GJC3Q8NFK1 279 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 OR8K5Q8NH50 307 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 RASSF8Q8NHQ8 419 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 URGCPQ8TCY9 931 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 CORO2AQ92828 525 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 FBXL8Q96CD0 374 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 RNF183Q96D59 192 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 AK8Q96MA6 479 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ATP6V0BQ99437 205 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 WNT16Q9UBV4 365 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ZMYM6O95789 1325 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 NEDD4P46934 1319 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 LCTP09848 1927 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 CCDC69A6NI79 296 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ENO4A6NNW6 628 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 HIDE1A8MVS5 230 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 P4HA1P13674 534 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ETFAP13804 333 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 KRT4P19013 534 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 NOVP48745 357 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 SLC26A2P50443 739 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 GPR143P51810 404 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ZNF131P52739 623 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 SORDQ00796 357 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ITGADQ13349 1161 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 NAE1Q13564 534 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 RCN2Q14257 317 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 PTPAQ15257 358 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 PTPN14Q15678 1187 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 DLG2Q15700 870 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 SFMBT2Q5VUG0 894 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 KRT39Q6A163 491 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZNX1 250 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms