RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354050.8

PLTP-201, Transcript of phospholipid transfer protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLTP, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTP-201ENST00000354050 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MGAT4DA6NG13 374 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 CHUKO15111 745 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 CPOXP36551 454 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 HTR6P50406 440 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TDGQ13569 410 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 CCINQ13939 588 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 GRB7Q14451 532 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 KIF19Q2TAC6 998 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 HLA-CQ95604 372 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.69□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 GPR89BP0CG08 455 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 PRR35P0CG20 571 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 C7P10643 843 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 PTK2BQ14289 1009 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 NFE2L1Q14494 772 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 OGFOD2Q6N063 350 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 NEK5Q6P3R8 708 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 FAM124AQ86V42 546 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 AMZ2Q86W34 360 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 OXR1Q8N573 874 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 FAM13CQ8NE31 585 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 LGR4Q9BXB1 951 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 ACTR8Q9H981 624 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 OR1A2Q9Y585 309 aa14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 KRT87PA6NCN2 255 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 CLDN9O95484 217 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 NDUFV2P19404 249 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 IGFALSP35858 605 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 TRIM23P36406 574 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 SLC25A3Q00325 362 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 RPA4Q13156 261 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 GSTA3Q16772 222 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 AGKQ53H12 422 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 XKR5Q6UX68 686 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 GK5Q6ZS86 529 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 FOXJ1Q92949 421 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 KLHL33A6NCF5 533 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 SHISA7A6NL88 538 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 A8MUI8 341 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MAN2B1O00754 1011 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 KMOO15229 486 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 PEX11AO75192 247 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 C1orf105O95561 183 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 IDO1P14902 403 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 EPORP19235 508 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 ITGAXP20702 1163 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 CD72P21854 359 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 ITPKAP23677 461 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 NUDT2P50583 147 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 MIER2Q8N344 545 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 OR2T11Q8NH01 316 aa14.66□□□□□ -0.06
PLTP-201ENST00000354050 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms