RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RDH11Q8TC12 318 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 QRFPRQ96P65 431 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 IL17FQ96PD4 163 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FAM129BQ96TA1 746 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM4Q9C037 500 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CD93Q9NPY3 652 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.34□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A5O15375 505 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 GPLD1P80108 840 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC1A5Q15758 541 aa4.34□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.34□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCL4L1Q8NHW4 92 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC13A3Q8WWT9 602 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 REPS1Q96D71 796 aa4.34□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.34□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GPR21Q99679 349 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NLGN3Q9NZ94 848 aa4.34□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 GABRG3Q99928 467 aa4.33□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 VSNL1P62760 191 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY2Q08462 1091 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MESP2Q0VG99 397 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TGIF1Q15583 401 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NSDHLQ15738 373 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.33□□□□□ -1.72
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