RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 LACC1Q8IV20 430 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 KIAA1191Q96A73 305 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DUSP21Q9H596 190 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 AMBNQ9NP70 447 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RNF186Q9NXI6 227 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GPR182O15218 404 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SEPT4O43236 478 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 LDB2O43679 373 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PGFP49763 221 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CYP4F3Q08477 520 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GBX1Q14549 363 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 METTL6Q8TCB7 284 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PCTPQ9UKL6 214 aa14.47□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 MROH6A6NGR9 719 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SLC16A6O15403 523 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 AIREO43918 545 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 LIPAP38571 399 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PIK3CGP48736 1102 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GALNT3Q14435 633 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CD274Q9NZQ7 290 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CDH23Q9H251 3354 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 AP3D1O14617 1153 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RGS13O14921 159 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CA12O43570 354 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 B4GALT3O60512 393 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TSPAN3O60637 253 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ADAMTS4O75173 837 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CAPN1P07384 714 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 LHX1P48742 406 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 FAM209AQ5JX71 171 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CEP68Q76N32 757 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NETO1Q8TDF5 533 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TP53INP1Q96A56 240 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 YME1L1Q96TA2 773 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GPR21Q99679 349 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ZNF221Q9UK13 617 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CDH9Q9ULB4 789 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.46□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 M0QX08 132 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 NPPAP01160 153 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 SLC2A4P14672 509 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 MARC1Q5VT66 337 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 GPR152Q8TDT2 470 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.46□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 GADD45AP24522 165 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 TGFBR2P37173 567 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 SREBF2Q12772 1141 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 CARD16Q5EG05 197 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 C10orf111Q8N326 155 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 SETD9Q8NE22 299 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 HMCESQ96FZ2 354 aa14.45□□□□□ -0.1
MSI1-201ENST00000257552 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms