RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 KCNJ1P48048 391 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CLCQ05315 142 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MEA1Q16626 185 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MARK4Q96L34 752 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ACCSQ96QU6 501 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OR51M1Q9H341 326 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RERGLQ9H628 205 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 A0A1W2PPL8 197 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 B4E171 279 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GSRP00390 522 aa6.63□□□□□ -1.35
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PDGFRA-201ENST00000257290 CD36P16671 472 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MAPK1P28482 360 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PCGF2P35227 344 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CDH6P55285 790 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RDH13Q8NBN7 331 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM151AQ8WW52 585 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 HAVCR1Q96D42 359 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM122AQ96E09 287 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TCF25Q9BQ70 676 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TLE6Q9H808 572 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GSAPA4D1B5 854 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GH1P01241 217 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DPEP1P16444 411 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZP3P21754 424 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CASP6P55212 293 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TAS2R60P59551 318 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TGFB2P61812 414 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TRAM1Q15629 374 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RAD54LQ92698 747 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CALML5Q9NZT1 146 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 POLLQ9UGP5 575 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 STUB1Q9UNE7 303 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 INVSQ9Y283 1065 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 A0A0G2JLW4 131 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LYPLA2O95372 231 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NOS3P29474 1203 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DHCR24Q15392 516 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NR6A1Q15406 480 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SGCAQ16586 387 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 POC1BQ8TC44 478 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 IFT27Q9BW83 186 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RNF121Q9H920 327 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 F5H6K3 240 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 M0QYV0 167 aa6.63□□□□□ -1.35
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PDGFRA-201ENST00000257290 ATE1O95260 518 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TMEM253P0C7T8 217 aa6.63□□□□□ -1.35
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PDGFRA-201ENST00000257290 GCH1P30793 250 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GMPRP36959 345 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RBP2P50120 134 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MPP1Q00013 466 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KLRC3Q07444 240 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF543Q08ER8 600 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CDC20Q12834 499 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RSU1Q15404 277 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DUPD1Q68J44 220 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CENPPQ6IPU0 288 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.63□□□□□ -1.35
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