RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 FIBINQ8TAL6 211 aa9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PEX13Q92968 403 aa9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ULK4Q96C45 1275 aa9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ARL15Q9NXU5 204 aa9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 WASH3PC4AMC7 463 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TRIM38O00635 465 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 AKAP10O43572 662 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LEFTY1O75610 366 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ESRRBO95718 433 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 G6PDP11413 515 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PPP3CCP48454 512 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ABRQ12979 859 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 IRGCQ6NXR0 463 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 KLHL35Q6PF15 583 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RTL10Q7L3V2 364 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GALNT7Q86SF2 657 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ITFG1Q8TB96 612 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PMM1Q92871 262 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 EME1Q96AY2 570 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CIB1Q99828 191 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 S1PR5Q9H228 398 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 P2RY12Q9H244 342 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 NME4O00746 187 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 OLFM2O95897 454 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 B3GALT4O96024 378 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TFPTP0C1Z6 253 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ACRV1P26436 265 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 HOXA9P31269 272 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CD300CQ08708 224 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 NR1D2Q14995 579 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 NXPE1Q8N323 547 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ZBTB2Q8N680 514 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 JADE3Q92613 823 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SEPHS2Q99611 448 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 COPS8Q99627 209 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GMNNO75496 209 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LRATO95237 230 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PGM3O95394 542 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CEBPBP17676 345 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 IL12AP29459 219 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CCR7P32248 378 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RGS4P49798 205 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 KCNK10P57789 538 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 MTPNP58546 118 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 NFKB2Q00653 900 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 MAPRE2Q15555 327 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 AAGABQ6PD74 315 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 Q6ZSR9 355 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LILRB2Q8N423 598 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SFRP1Q8N474 314 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 IRF7Q92985 503 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.76□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TMEM202A6NGA9 273 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 OR7A17O14581 309 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ACOT8O14734 319 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RAD51BO15315 384 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TAPBPO15533 448 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms