RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202769.1

Trim54-202, Transcript of Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene Trim54, Length 1,408 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54-202ENSMUST00000202769 Erich6bQ9D4S6 220 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tex9Q9D845 387 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Kcne5Q9QZ26 143 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Bmp10Q9R229 421 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Oc90Q9Z0L3 485 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 H2-BlV9GXR0 257 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cyp4a32A2A8T1 509 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm15091B1AZM2 449 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Akap5D3YVF0 745 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 SmgcF6VRN1 385 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Pik3r2O08908 722 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Bmp7P23359 430 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 WarsP32921 481 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Nkx2-6P43688 289 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 E330014E10RikQ3UL33 481 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 D5Ertd577eQ499F0 481 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Mep1bQ61847 704 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tas2r38Q7TQA6 331 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr1418Q7TQS3 318 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Dnali1Q8BVN8 258 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gpat3Q8C0N2 438 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Galnt5Q8C102 930 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ttc23Q8CHY7 488 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Lurap1lQ8K2P1 221 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zfyve21Q8VCM3 234 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr382Q8VF79 312 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Asf1aQ9CQE6 204 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cdc20Q9JJ66 499 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 RpgrQ9R0X5 1001 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 AadatQ9WVM8 425 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Trgv2A2J008 116 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rhox1B1APN4 224 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rgsl1H3BL40 1073 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Sh2d1bO35324 132 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Adra1bP97717 514 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Polr2cP97760 275 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 InhbaQ04998 424 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Atf7ip2Q3UL97 452 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Osbp2Q5QNQ6 908 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ddrgk1Q80WW9 315 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zfp454Q80Y34 536 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 FRRS1Q8K385 592 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Armcx6Q8K3A6 301 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Haus3Q8QZX2 570 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Znf768Q8R0T2 568 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr606Q8VGZ8 319 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Pcdhb20Q91XZ9 799 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Sugt1Q9CX34 336 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Plscr2Q9DCW2 307 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tcf23Q9JLR5 209 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Slc25a13Q9QXX4 676 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Wnt16Q9QYS1 364 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 ProdhQ9WU79 599 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cst9Q9Z0H6 137 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 AgrnA2ASQ1 1950 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ttll9A2APC3 461 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Lonrf2B2RT44 518 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Lce6aD3YV94 81 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm29394H3BIW7 199 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm7942L7N277 499 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr1513L7N457 313 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 ColqO35348 457 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfm1O88998 485 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 GuloP58710 440 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 G6pdxQ00612 515 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm5460Q3UQ97 254 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Slc22a16Q497L8 649 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 RalyQ64012 312 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr1134Q7TR43 312 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Fbxl4Q8BH70 621 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Snrnp27Q8K194 155 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Fitm1Q91V79 292 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Senp2Q91ZX6 588 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Prr23a3Q9CWP9 254 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 AcadsbQ9DBL1 432 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ccdc97Q9DBT3 340 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cyp4f14Q9EP75 524 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ptprz1B9EKR1 2312 aa15.96■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tmem74bA2AU34 232 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Lrrc31F6VYM1 502 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rnf148G3X9R7 316 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Capn6O35646 641 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Jmjd7P0C872 316 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 MaxP28574 160 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Kcnab1P63143 401 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Alkbh5Q3TSG4 395 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Slc9b2Q5BKR2 547 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Prkaa1Q5EG47 559 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Slc25a51Q5HZI9 298 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Trim54-202ENSMUST00000202769 Prr14Q7TPN9 612 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.3 ms