RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam131cA2ADB2 273 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AccsA2AIG8 502 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Inpp1P49442 396 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RalgdsQ03385 852 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pacs2Q3V3Q7 862 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pik3r3Q64143 461 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PolnQ7TQ07 864 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BtdQ8CIF4 520 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gas2l1Q8JZP9 678 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SuoxQ8R086 546 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ms4a10Q99N03 267 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arl8bQ9CQW2 186 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MycsQ9Z304 431 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4931406B18RikA2RSL7 367 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Spin2dB1B0R2 236 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn2r103E9PWW0 856 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 E2f3O35261 457 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dsg2O55111 1122 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Il1rl1P14719 567 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ap1g1P22892 822 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Guca1aP43081 202 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sox1P53783 391 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atp6v1b2P62814 511 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kir3dl1P83555 432 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 StimateQ3UF25 288 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Itpripl2Q3UV16 535 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 XiapQ60989 496 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RgnQ64374 299 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Usp8Q80U87 1080 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arhgap19Q8BRH3 494 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ston2Q8BZ60 895 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sfrp1Q8C4U3 314 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RtknQ8C6B2 564 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Abhd11Q8K4F5 307 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr315Q8VFG7 309 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sohlh2Q9D489 467 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc130Q9D516 385 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Glod5Q9D8I3 148 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tssc4Q9JHE7 317 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AadatQ9WVM8 425 aa12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mllt3A2AM29 569 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 E2f6O54917 272 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Treml2Q2LA85 329 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr384Q7TRX8 312 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 C2cd2lQ80X80 706 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Creb5Q8K1L0 357 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nudt4Q8R2U6 179 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc22a19Q8VCA0 551 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr690Q8VH18 315 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem114Q9D563 222 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1700086D15RikQ9D9E9 151 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PyglQ9ET01 850 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Capn15Q9JLG8 1095 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CdylQ9WTK2 593 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Apol8A2VDH7 339 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Saxo1B1AXP3 476 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zc3h12aQ5D1E7 596 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbc1d1Q60949 1255 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pou4f2Q63934 411 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rnf38Q8BI21 518 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Golga7Q91W53 137 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slco6d1Q9D5W6 683 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpr45Q9EQQ4 373 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm28360A0A087WR25 190 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mup6A2AV72 179 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NuggcD3YWJ0 796 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RfngO09009 332 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Azin1O35484 448 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bmp7P23359 430 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc10a7Q5PT53 340 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Taar7fQ5QD08 358 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lcp2Q60787 533 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fgfr3Q61851 801 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Paqr3Q6TCG8 311 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf569Q80W31 679 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gtf2h3Q8VD76 309 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam69bQ99ML4 431 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AvenQ9D9K3 342 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 UxtQ9WTZ0 157 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 LtfP08071 707 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mkl2P59759 1080 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rps17P63276 135 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CamkvQ3UHL1 512 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa12.73□□□□□ -0.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mocs1Q5RKZ7 636 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms