RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slco1a4Q9EP96 670 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prokr1Q9JKL1 393 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znhit2Q9QY66 399 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rgs20Q9QZB1 239 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chrna6Q9R0W9 494 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clic1Q9Z1Q5 241 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700001O22RikA2APZ1 375 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd16A2AS55 361 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mterf1bB9EJ57 379 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acbd4E9Q289 327 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7535F7CXE4 302 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21897J3KMP5 500 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21750L7N228 499 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Neurod4O09105 330 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pole2O54956 527 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01810 119 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MndaP0DOV1 425 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdha2P35487 391 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Etv2P41163 335 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PuraP42669 321 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap39P59281 1107 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hpcal1P62748 193 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BcheQ03311 603 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c65Q148B1 490 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ipcef1Q5DU31 406 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Angptl1Q640P2 490 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gba2Q69ZF3 918 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif18bQ6PFD6 834 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc39a4Q78IQ7 660 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas2r131Q7M708 310 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adgrd1Q80T32 903 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TxlngQ8BHN1 524 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ncs1Q8BNY6 190 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clec1aQ8BWY2 269 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lpcat2Q8BYI6 544 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam78aQ8C552 283 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r215Q8R264 300 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc92Q8VDN4 314 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr691Q8VGW5 322 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mob2Q8VI63 235 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 KmoQ91WN4 479 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhga11Q91XY8 933 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptgr1Q91YR9 329 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpd52l3Q9CQ14 231 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chaf1bQ9D0N7 572 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Upk3bl1Q9D701 249 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znrf4Q9DAH2 327 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GabarapQ9DCD6 117 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxo17Q9QZM8 286 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc2a5Q9WV38 501 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d25A1A5B6 742 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pkd2l1A2A259 760 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pramef25A2ASI9 494 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gbp11A9YVJ5 442 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13212B1ASQ7 799 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm44G3UW88 330 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10715J3QP74 227 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5724L7N264 670 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PigfO09101 219 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxc8P09025 242 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc2a2P14246 523 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mbl1P39039 239 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tm9sf2P58021 662 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RogdiQ3TDK6 287 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uimc1Q5U5Q9 727 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc6a4Q60857 630 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hesx1Q61658 185 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cox8aQ64445 69 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Colgalt2Q6NVG7 625 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lix1Q6P566 282 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Galnt2Q6PB93 570 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rap2aQ80ZJ1 183 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TiprlQ8BH58 271 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rcor1Q8CFE3 480 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mbtps2Q8CHX6 515 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Steap3Q8CI59 488 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam83aQ8K2P2 436 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RorbQ8R1B8 470 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1352Q8VGX5 309 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sp7Q8VI67 428 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptov1Q91VU8 416 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa2013Q91X21 634 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mta3Q924K8 591 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Msh4Q99MT2 958 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcam1Q99NB3 548 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim16Q99PP9 556 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcb8Q9CXJ4 717 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glod5Q9D8I3 148 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9DAD0 168 aa6.48□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PgdQ9DCD0 483 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.3 ms