RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 KYQ8NBH2 561 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PHC3Q8NDX5 983 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 OR4C6Q8NH72 309 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MAPK15Q8TD08 544 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PGM2Q96G03 612 aa8.31□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 DERL2Q9GZP9 239 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.31□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 ASF1AQ9Y294 204 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JNG1 304 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 OR5K4A6NMS3 321 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 C4orf47A7E2U8 309 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CDC7O00311 574 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM38O00635 465 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 COPEO14579 308 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SIGLEC6O43699 453 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB14O43829 449 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 OPA1O60313 960 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GDF9O60383 454 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NOBOXO60393 691 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MATN4O95460 622 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 RPN2P04844 631 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 C8GP07360 202 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 COL6A2P12110 1019 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MYF5P13349 255 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TFEBP19484 476 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TGM1P22735 817 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CCNFP41002 786 aa8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 GLRBP48167 497 aa8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 SFRP1Q8N474 314 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ARL10Q8N8L6 244 aa8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 OR5K2Q8NHB8 316 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ASB11Q8WXH4 323 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NXNL1Q96CM4 212 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SCYL1Q96KG9 808 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SMC6Q96SB8 1091 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 HGH1Q9BTY7 390 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 ALG9Q9H6U8 611 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NMRAL1Q9HBL8 299 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF358Q9NW07 568 aa8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SLC16A5O15375 505 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 FLRT2O43155 660 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ATP8B1O43520 1251 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GLRA3O75311 464 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SPAG7O75391 227 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf105O95561 183 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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