RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 EVPLLA8MZ36 301 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 CENPBD1B2RD01 187 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 SH3BGRLO75368 114 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 PAGE1O75459 146 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 CREG1O75629 220 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 GJB3O75712 270 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 PRSS23O95084 383 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 PPP2R2BQ00005 443 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 PON2Q15165 354 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 TTC23LQ6PF05 361 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 SVOPLQ8N434 492 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 CHST13Q8NET6 341 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 NETO1Q8TDF5 533 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 SLC38A4Q969I6 547 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 YME1L1Q96TA2 773 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 ITPAQ9BY32 194 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 TRIM64BA6NI03 449 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 PER2O15055 1255 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 MATN3O15232 486 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 SMARCB1Q12824 385 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 ABCB9Q9NP78 766 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 TREX1Q9NSU2 369 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-235ENST00000616247 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 SCN1AP35498 2009 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 A0A0U1RQS6 177 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 IQCF5A8MTL0 148 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 FAM25AB3EWG3 89 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 FAM25CB3EWG5 89 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 FAM25GB3EWG6 89 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 TLL1O43897 1013 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 NIPSNAP2O75323 286 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 NDST3O95803 873 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 LGALS2P05162 132 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-235ENST00000616247 FGF4P08620 206 aa6.54□□□□□ -1.36
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