RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 EHD3Q9NZN3 535 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PTGFRNQ9P2B2 879 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB26Q9ULW5 256 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 CXCR6O00574 342 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 COX10Q12887 443 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB6Q15916 424 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 DCLK1O15075 740 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 LYNP07948 512 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 CREB5Q02930 508 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PCLAFQ15004 111 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ENKURQ8TC29 256 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 DUSP26Q9BV47 211 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF186Q9NXI6 227 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 TYROBPO43914 113 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A12O75746 678 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ITPKBP27987 946 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 GDF5P43026 501 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 AP1S2P56377 157 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 RING1Q06587 406 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 CHID1Q9BWS9 393 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC32A1Q9H598 525 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR26Q9H7D7 661 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 LCHNA4D1U4 455 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SCN2BO60939 215 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 UGT2B11O75310 529 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 RFPL1O75677 317 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 LAMP2P13473 410 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 GHRHRQ02643 423 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 NR1D2Q14995 579 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 C17orf99Q6UX52 265 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 BCKDKO14874 412 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 TIE1P35590 1138 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNFP41002 786 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 IGSF8Q969P0 613 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 H3BNH8 94 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 hCG_2039718K7EN88 272 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 LEFTY2O00292 366 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 GKP32189 559 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTR1BP42025 376 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTR1AP61163 376 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 MPP2Q14168 576 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 POF1BQ8WVV4 589 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 E7ESA3 106 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 HNMTP50135 292 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC3Q9BY71 257 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0G2JN53 185 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH7O60245 1069 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 VIPR1P32241 457 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 C1QTNF8P60827 252 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 HERC3Q15034 1050 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 PSKH2Q96QS6 385 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ALAS2P22557 587 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC26A3P40879 764 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC34A3Q8N130 599 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms