RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	OARD1	Q9Y530	152 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916		A0A1B0GTL3	188 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SYCE1L	A8MT33	242 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	MATN2	O00339	956 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	EBAG9	O00559	213 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PPP6C	O00743	305 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	KPNA5	O15131	536 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TAPBP	O15533	448 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	FFAR2	O15552	330 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	GRID2	O43424	1007 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LAT	O43561	262 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SUPT7L	O94864	414 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	MATN4	O95460	622 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ACADM	P11310	421 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	GFAP	P14136	432 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PDHA2	P29803	388 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	FNTB	P49356	437 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	DGKE	P52429	567 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CDH13	P55290	713 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	DMTN	Q08495	405 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	IFT88	Q13099	833 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PRKAA1	Q13131	559 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SGCG	Q13326	291 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LRRC32	Q14392	662 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CCT6B	Q92526	530 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	FOXJ1	Q92949	421 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	GLMN	Q92990	594 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ESAM	Q96AP7	390 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	EBF4	Q9BQW3	602 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	COG4	Q9H9E3	785 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	EBF2	Q9HAK2	575 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	FZD3	Q9NPG1	666 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CD274	Q9NZQ7	290 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF225	Q9UK10	706 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PCTP	Q9UKL6	214 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TMCO1	Q9UM00	188 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PDE10A	Q9Y233	779 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	OR1A2	Q9Y585	309 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916		A0A0G2JND7	137 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	KRT87P	A6NCN2	255 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	POM121B	A6NF01	834 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	MGAT4D	A6NG13	374 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM233	B4DJY2	109 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	E2F3	O00716	465 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLC16A5	O15375	505 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SLC31A1	O15431	190 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV4-34	P06331	123 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	CEACAM5	P06731	702 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	C8G	P07360	202 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	GSTM1	P09488	218 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	TSPAN8	P19075	237 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	PREP	P48147	710 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	IDH3A	P50213	366 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	ARFIP2	P53365	341 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PVT1-222	ENST00000613916	AQP5	P55064	265 aa		7.16	□□□□□ -1.26

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