RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	FANCG	O15287	622 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	KCNJ13	O60928	360 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	POLB	P06746	335 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	RARA	P10276	462 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	ARL4A	P40617	200 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	CEBPE	Q15744	281 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	INA	Q16352	499 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	IL26	Q9NPH9	171 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	CTSF	Q9UBX1	484 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUP62-216	ENST00000599560	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ADAM10	O14672	748 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SGTA	O43765	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	RNF8	O76064	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	RASAL1	O95294	804 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CES1	P23141	567 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PPP2R2A	P63151	447 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	HAS2	Q92819	552 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	WDPCP	O95876	746 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ALAS2	P22557	587 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CA4	P22748	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SERPINB6	P35237	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ADAM8	P78325	824 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PCSK7	Q16549	785 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SCN2A	Q99250	2005 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	KCNK1	O00180	336 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CD63	P08962	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PRR35	P0CG20	571 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	UGT2B7	P16662	529 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms