RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	SNX31	Q8N9S9	440 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	EXOC2	Q96KP1	924 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	EGFL8	Q99944	293 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	HPS4	Q9NQG7	708 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EI24	O14681	340 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR1I1	O60431	355 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TPST1	O60507	370 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TSPAN3	O60637	253 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ABLIM3	O94929	683 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANXA5	P08758	320 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRSS56	P0CW18	603 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARSA	P15289	507 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	NFKBIA	P25963	317 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPAM1	P38567	509 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EPHB3	P54753	998 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	HPCA	P84074	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ECT2L	Q008S8	904 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	IL18R1	Q13478	541 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDH18	Q13634	790 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	BROX	Q5VW32	411 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SBSN	Q6UWP8	590 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR2T11	Q8NH01	316 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ACOX2	Q99424	681 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CIPC	Q9C0C6	399 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ING2	Q9H160	280 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ASB8	Q9H765	288 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR7A17	O14581	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC16A5	O15375	505 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	KLKB1	P03952	638 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	C8G	P07360	202 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RET	P07949	1114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	THRB	P10828	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	G6PD	P11413	515 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PFKL	P17858	780 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ACRV1	P26436	265 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SERPINA4	P29622	427 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	NSG1	P42857	185 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CREM	Q03060	361 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TCF15	Q12870	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ABR	Q12979	859 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	NFATC2	Q13469	925 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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