RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CLPBQ9H078 707 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 LATS2Q9NRM7 1088 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 FBP2O00757 339 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 MRASO14807 208 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 GIPC1O14908 333 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PIP5K1BO14986 540 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 NPC1O15118 1278 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF217O75362 1048 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 LMAN2Q12907 356 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R3AQ16821 1122 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM215Q68D42 235 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC23LQ6PF05 361 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC36A4Q6YBV0 504 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 LMLNQ96KR4 655 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A17Q9H1V8 727 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PILRBQ9UKJ0 227 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CRCPO75575 148 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 IL12RB1P42701 662 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 XKR7Q5GH72 579 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 LYSMD4Q5XG99 296 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF111Q6ZNA4 994 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 APCDD1Q8J025 514 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLM1Q8NBJ4 401 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2AP1Q8NGE2 309 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 GATA6Q92908 595 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf30Q96M34 536 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 RIC8BQ9NVN3 520 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ELOVL2Q9NXB9 296 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM181Q9P2C4 612 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 DYTNA2CJ06 578 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 AGAP14A8MT82 685 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CFLARO15519 480 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1I1O60431 355 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK5O95279 499 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 C8BP07358 591 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CD1EP15812 388 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPKAP23677 461 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 DPP6P42658 865 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM61Q5EBN2 209 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CDKL4Q5MAI5 379 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 MACC1Q6ZN28 852 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PLPP6Q8IY26 295 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ADCY4Q8NFM4 1077 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 BPIFA1Q9NP55 256 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CD93Q9NPY3 652 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC167Q9P0B6 97 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CD300AQ9UGN4 299 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 IKZF3Q9UKT9 509 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 MT-CO1P00395 513 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 DGKAP23743 735 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SPAM1P38567 509 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 NFATC2Q13469 925 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT11Q495W5 492 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC23A3Q6PIS1 610 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINA9Q86WD7 417 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PDPRQ8NCN5 879 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 EID2BQ96D98 161 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ECHDC3Q96DC8 303 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC30A3Q99726 388 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 HGH1Q9BTY7 390 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 GID8Q9NWU2 228 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 POLG2Q9UHN1 485 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SCOCQ9UIL1 159 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP8B1Q9UNU6 501 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD51BO15315 384 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 S100BP04271 92 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXD12P35452 270 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TGFBIQ15582 683 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMK1DQ8IU85 385 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 FUNDC1Q8IVP5 155 aa24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms