RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 AGXTP21549 392 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 IDSP22304 550 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 RORAP35398 523 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ETFBP38117 255 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 MMP12P39900 470 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 TXLNAP40222 546 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 FOLR3P41439 243 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 SLC19A1P41440 591 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 KIR2DL3P43628 341 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ACADSBP45954 432 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 GPR1P46091 355 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 CENPAP49450 140 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 TNFSF10P50591 281 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 RHOAP61586 193 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 OLR1P78380 273 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ARG2P78540 354 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 HSD11B2P80365 405 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 UBXN1Q04323 297 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 PPP3CAQ08209 521 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 CETN1Q12798 172 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 RALGDSQ12967 914 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 CBX3Q13185 183 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 NME3Q13232 169 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 MFAP5Q13361 173 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 OLIG2Q13516 323 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 SNX1Q13596 522 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 LBRQ14739 615 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 GRM3Q14832 879 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 KIR2DS5Q14953 304 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 TCEAL1Q15170 157 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 STILQ15468 1287 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 GPR19Q15760 415 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 SNCBQ16143 134 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 FKBP15Q5T1M5 1219 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 TMTC4Q5T4D3 741 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 DENND2CQ68D51 928 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM211Q6ICI0 200 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ARSKQ6UWY0 536 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 NAPRTQ6XQN6 538 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 C3P1Q6ZMU1 363 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 CAPN12Q6ZSI9 719 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 HDXQ7Z353 690 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ZSWIM9Q86XI8 627 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 KMT5CQ86Y97 462 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 CAMK1DQ8IU85 385 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 GALNT13Q8IUC8 556 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 P3H2Q8IVL5 708 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ZZZ3Q8IYH5 903 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF683Q8IZ20 524 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 DEFB106AQ8N104 65 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 EID3Q8N140 333 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 D2HGDHQ8N465 521 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 AVL9Q8NBF6 648 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 BBOF1Q8ND07 529 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ANKK1Q8NFD2 765 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 OR8K5Q8NH50 307 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 MAGEC3Q8TD91 643 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 EPS8L1Q8TE68 723 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 TRPC4APQ8TEL6 797 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 TFAP2BQ92481 460 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 SHC3Q92529 594 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 RSC1A1Q92681 617 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 SEMA4DQ92854 862 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 NRBF2Q96F24 287 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 MAGED4Q96JG8 741 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 C1orf74Q96LT6 269 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 Q96MF0 132 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 COQ10AQ96MF6 247 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 MOGAT1Q96PD6 335 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 DMRTA2Q96SC8 542 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 MAP3K3Q99759 626 aa2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNORD53-201ENST00000579969 TUBA1CQ9BQE3 449 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms