RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 A0A1B0GVT2 93 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 NEMP2A6NFY4 417 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RFXANKO14593 260 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 COX4I1P13073 169 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CCNB1P14635 433 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 POU2F1P14859 743 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ABOP16442 354 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ARG2P78540 354 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FOLH1Q04609 750 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PDK3Q15120 406 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 GPR68Q15743 365 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ELOA3Q8NG57 546 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RAB4AP20338 218 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MPSTP25325 297 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FMO1Q01740 532 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ARSIQ5FYB1 569 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 GATSQ8NAP1 163 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 IL21RQ9HBE5 538 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF639Q9UID6 485 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CLEC3BP05452 202 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MAGEA11P43364 429 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 HTRA3P83110 453 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TREML2Q5T2D2 321 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 LINGO2Q7L985 606 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SPOCK2Q92563 424 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.087e-7■■■■■ 26.9
PDPR-210ENST00000568530 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 UROC1Q96N76 676 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 OR52E6Q96RD3 313 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SULT2A1Q06520 285 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RAB30Q15771 203 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RCN3Q96D15 328 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TDP1Q9NUW8 608 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ARPC2O15144 300 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RENP00797 406 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 TRBC1P01850 177 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 LHCGRP22888 699 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ACVR2AP27037 513 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 ACLYP53396 1101 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 RIPK1Q13546 671 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FXNQ16595 210 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 PPM1JQ5JR12 505 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 GKN2Q86XP6 184 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 AZIN2Q96A70 460 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.31□□□□□ -1.08
PDPR-210ENST00000568530 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms