RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559491.1

RNF31-215, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 2

Gene RNF31, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-215	ENST00000559491	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	PBK	Q96KB5	322 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	SPATA13	Q96N96	652 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	COPS8	Q99627	209 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	LRRK2	Q5S007	2527 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	ESPL1	Q14674	2120 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF31-215	ENST00000559491	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	MEN1	O00255	615 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	CTSB	P07858	339 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ITGAL	P20701	1170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ACRV1	P26436	265 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	PTPN7	P35236	360 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	RORA	P35398	523 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	GDF10	P55107	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	KRT33B	Q14525	404 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	TRIM73	Q86UV7	250 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	CREG2	Q8IUH2	290 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ING2	Q9H160	280 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	LUZP4	Q9P127	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	BLACE	A4D250	179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	RALB	P11234	206 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	GNLY	P22749	145 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	NDUFS1	P28331	727 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ITGA1	P56199	1179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	RWDD2B	P57060	319 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	FOXL2	P58012	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	PDE1B	Q01064	536 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	POU6F1	Q14863	301 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	BRD3	Q15059	726 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ZIC1	Q15915	447 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	DBN1	Q16643	649 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	OR8K5	Q8NH50	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF31-215	ENST00000559491	THAP4	Q8WY91	577 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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