RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 CASP2P42575 452 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 HSPA7P48741 367 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 HNMTP50135 292 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ALDH3A2P51648 485 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CLDN8P56748 225 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 OR4D2P58180 307 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 TTC23Q5W5X9 447 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 GPR141Q7Z602 305 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 APCDD1Q8J025 514 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 SVOPLQ8N434 492 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ITFG1Q8TB96 612 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC13A3Q8WWT9 602 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 LZICQ8WZA0 190 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 GTF2H4Q92759 462 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 LMLNQ96KR4 655 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 RNF145Q96MT1 663 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM74Q96NL1 305 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CDK15Q96Q40 435 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 EGFL8Q99944 293 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 C1orf50Q9BV19 199 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CEP44Q9C0F1 390 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 KCNH6Q9H252 994 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CLMPQ9H6B4 373 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 NTN4Q9HB63 628 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 RAD18Q9NS91 495 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 WWOXQ9NZC7 414 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 A0A096LPI6 279 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 SOBPA7XYQ1 873 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 C9JVG2 144 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 GFYI3L273 518 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 K7ERQ8 282 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 UPK1AO00322 258 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 NUAK1O60285 661 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRMT3O60678 531 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 AOC2O75106 756 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ALBP02768 609 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 PGRP06401 933 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 RETP07949 1114 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 OR56A5P0C7T3 313 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ETS2P15036 469 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 NCK1P16333 377 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 HIST1H2ADP20671 130 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 AOAHP28039 575 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRPC1P48995 793 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPIAP49247 311 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 HTR6P50406 440 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 HLCSP50747 726 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPS6KA3P51812 740 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 DGKQP52824 942 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABRQ12979 859 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
UBE2CP1-201ENST00000557130 TUBA3CQ13748 450 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms