RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 DERL2Q9GZP9 239 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 HOXD1Q9GZZ0 328 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 C1orf21Q9H246 121 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 RMND5AQ9H871 391 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 ACSS2Q9NR19 701 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 NUP50Q9UKX7 468 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-204ENST00000546621 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.65□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 OR5K3A6NET4 321 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 ZNF839A8K0R7 811 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 WASH3PC4AMC7 463 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 H3BMM5 538 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 H3BSA7 217 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 BNIP3LO60238 219 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 NUAK1O60285 661 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 OR1I1O60431 355 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 VPS26AO75436 327 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 GMNNO75496 209 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 BMP10O95393 424 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 PAPLNO95428 1278 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 CLDN7O95471 211 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 PRAMEF1O95521 474 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 ESR1P03372 595 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 GSTM1P09488 218 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 AOC1P19801 751 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 ITGALP20701 1170 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 PTGS2P35354 604 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 PRSS12P56730 875 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 RAD51Q06609 339 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 DHCR24Q15392 516 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 SHHQ15465 462 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 OR4D1Q15615 310 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 DUSP6Q16828 381 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 SNX20Q7Z614 316 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 HM13Q8TCT9 377 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 AGR3Q8TD06 166 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 MAPK15Q8TD08 544 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 KCNJ9Q92806 393 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 KIAA1191Q96A73 305 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 PHF21BQ96EK2 531 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 TXNDC15Q96J42 360 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 GPR21Q99679 349 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 P2RY12Q9H244 342 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 SP140LQ9H930 580 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 NEK6Q9HC98 313 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 APPL1Q9UKG1 709 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 FAM50BQ9Y247 325 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 MYO7AQ13402 2215 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 E5RI56 91 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-204ENST00000546621 H0YJX3 145 aa7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms