RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545882.5

CNN3-207, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-207ENST00000545882 AKT1P31749 480 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 GGT5P36269 586 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 GZMMP51124 257 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 TWF1Q12792 350 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 AQP6Q13520 282 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 SMU1Q2TAY7 513 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 CHPFQ8IZ52 775 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 SLC15A4Q8N697 577 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 TTC16Q8NEE8 873 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 FRS2Q8WU20 508 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PLD4Q96BZ4 506 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 CD244Q9BZW8 370 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 NACA2Q9H009 215 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 RNF38Q9H0F5 515 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PSME2Q9UL46 239 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PKP3Q9Y446 797 aa14.97□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 J3QRK9 145 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 SLC28A1O00337 649 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 RGS14O43566 566 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 GMNNO75496 209 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 ALDH2P05091 517 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PGRP06401 933 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 IRF1P10914 325 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PRKACGP22612 351 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 NRIP1P48552 1158 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PSMD7P51665 324 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 ISL1P61371 349 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 SMARCB1Q12824 385 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 HECTD3Q5T447 861 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 ADGRF1Q5T601 910 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 MICU2Q8IYU8 434 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 SVOPLQ8N434 492 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 ITFG2Q969R8 447 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 FBXL8Q96CD0 374 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 ZBTB18Q99592 522 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 DPY30Q9C005 99 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 ASIC5Q9NY37 505 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 KLQ9UEF7 1012 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 FBXO10Q9UK96 956 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 TET1Q8NFU7 2136 aa14.96□□□□□ -0.01
CNN3-207ENST00000545882 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 MANBAO00462 879 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 BCL10O95999 233 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 COL6A1P12109 1028 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 DCTP40126 519 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GNPDA1P46926 289 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GABARAPL2P60520 117 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SPESP1Q6UW49 350 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GPR149Q86SP6 731 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 NETO1Q8TDF5 533 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 MUL1Q969V5 352 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 FAM162AQ96A26 154 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 FAM210AQ96ND0 272 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 NTMT1Q9BV86 223 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CLPBQ9H078 707 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SERHLQ9NQF3 203 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 PDE10AQ9Y233 779 aa14.96□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms