RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 DBN1Q16643 649 aa5.46□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa5.46□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM126BQ8IUX1 230 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.46□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.46□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 S1PR4O95977 384 aa5.45□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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CLSTN3-215ENST00000544584 SPESP1Q6UW49 350 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 DTX1Q86Y01 620 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 CNPY4Q8N129 248 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35F6Q8N357 371 aa5.45□□□□□ -1.54
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