RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM221BA6H8Z2 402 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 KDM1AO60341 852 aa16.01■□□□□ 0.15
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PACSIN3-210ENST00000533686 SAT1P21673 171 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNA4P22459 653 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CNTFP26441 200 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CD1CP29017 333 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CCNFP41002 786 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DHRS13Q6UX07 377 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CEP97Q8IW35 865 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.01■□□□□ 0.15
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PACSIN3-210ENST00000533686 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ASB11Q8WXH4 323 aa16.01■□□□□ 0.15
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PACSIN3-210ENST00000533686 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC77Q9BR77 488 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 NFS1Q9Y697 457 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 HMX2A2RU54 273 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 GFYI3L273 518 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DUX1O43812 170 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 UBXN7O94888 489 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CPNE6O95741 557 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPAN12O95859 305 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 STMN1P16949 149 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CRABP2P29373 138 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 HSD17B3P37058 310 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB10P61026 200 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PRKG2Q13237 762 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SPIDRQ14159 915 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PLCL1Q15111 1095 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MAP9Q49MG5 647 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TTC23LQ6PF05 361 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 KLHL35Q6PF15 583 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ADGRD1Q6QNK2 874 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM207Q6UWW9 146 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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PACSIN3-210ENST00000533686 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MREGQ8N565 214 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DCAKDQ8WVC6 231 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD7Q92527 254 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RAD51AP1Q96B01 352 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 LINGO1Q96FE5 620 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 HGH1Q9BTY7 390 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PPCSQ9HAB8 311 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SPTBN4Q9H254 2564 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RP1P56715 2156 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC16A5O15375 505 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 KRT38O76015 456 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MT-CO3P00414 261 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CATP04040 527 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PROS1P07225 676 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 C8GP07360 202 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 AMD1P17707 334 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 GCAP28676 217 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PGGT1BP53609 377 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF460Q14592 562 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 AMZ1Q400G9 498 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 LGSNQ5TDP6 509 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MROH9Q5TGP6 573 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 NKAIN2Q5VXU1 208 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 LCN9Q8WX39 176 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB33BQ9H082 229 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 GPAMQ9HCL2 828 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OGFRQ9NZT2 677 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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