RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 MECOMQ03112 1051 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 CUL4BQ13620 913 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 BLMHQ13867 455 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 TIGD6Q17RP2 521 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 KLHL26Q53HC5 615 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 RAB6CQ53S08 254 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 UTF1Q5T230 341 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 LCN1P1Q5VSP4 162 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 IRGCQ6NXR0 463 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 Q6P435 159 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM207Q6UWW9 146 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMUB2Q71RG4 321 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 GSTA5Q7RTV2 222 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR2L5Q8NG80 312 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 TTC8Q8TAM2 541 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM104AQ969W3 186 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 SDCCAG3Q96C92 435 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 RAB6CQ9H0N0 254 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 SAYSD1Q9NPB0 183 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF69Q9UC07 566 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDC23Q9UJX2 597 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 CLEC4EQ9ULY5 219 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 SCINQ9Y6U3 715 aa0.59□□□□□ -2.31
IGKV1-22-201ENST00000524313 FER1L5A0AVI2 2057 aa0.59□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR2M5A3KFT3 312 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 KLK10O43240 276 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GPC4O75487 556 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GCNT3O95395 438 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACP2P11117 423 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 UMPSP11172 480 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MDKP21741 143 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CA4P22748 312 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 HRH2P25021 359 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CST5P28325 142 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ELK3P41970 407 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 LBX1P52954 281 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 AK2P54819 239 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRTAP12-3P60328 96 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGBP1P78318 339 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 DHODHQ02127 395 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRKAA1Q13131 559 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 EBI3Q14213 229 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MTF1Q14872 753 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKRD1Q15327 319 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 COL28A1Q2UY09 1125 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ATG9AQ7Z3C6 839 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLD5Q8N7P1 536 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPFIBP2Q8ND30 876 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 STAG1Q8WVM7 1258 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGSF8Q969P0 613 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MAGEB18Q96M61 343 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MXD3Q9BW11 206 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 STRA6Q9BX79 667 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 NYXQ9GZU5 481 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRT84Q9NSB2 600 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CUTCQ9NTM9 273 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CLEC5AQ9NY25 188 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 COPG2Q9UBF2 871 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 RAB26Q9ULW5 256 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 VWA3AA6NCI4 1184 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKRD61A6NGH8 418 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 E9PI62 339 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACKR2O00590 384 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 SNAP91O60641 907 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 NR2C1P13056 603 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 IL7RP16871 459 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTPN3P26045 913 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDAP32320 146 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPM1AP35813 382 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACTR2P61160 394 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GTF3C1Q12789 2109 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLA2G7Q13093 441 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 SQLEQ14534 574 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF805Q5CZA5 627 aa0.57□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKRD45Q5TZF3 282 aa0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms