RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALNT2Q10471 571 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTP4A2Q12974 167 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFR3AQ14156 821 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSSK4Q6SA08 328 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM207Q6UWW9 146 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINGO4Q6UY18 593 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC17AQ6ZS10 378 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEPT14Q6ZU15 432 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC8DQ7L1W4 858 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM131BQ86XD5 332 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BADQ92934 168 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D20Q96BZ9 403 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARSGQ96EG1 525 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSL1Q96IY1 281 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGK494Q96LW2 274 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NECTIN4Q96NY8 510 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OVOL2Q9BRP0 275 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC28BQ9BUN5 200 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED20Q9H944 212 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPB41L5Q9HCM4 733 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXW11Q9UKB1 542 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTUS1Q9ULD2 1270 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAU2Q9Y6X3 613 aa0.6□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSPH10B2B2RC85 870 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAGE4O60829 102 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXH1O75593 365 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHEP01854 428 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSPH10BP0C881 870 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CA6P23280 308 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBX4P57082 545 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRKCZQ05513 592 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FCHO2Q0JRZ9 810 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHLDA2Q53GA4 152 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPDYCQ5MJ68 293 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CES4AQ5XG92 561 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANO1Q5XXA6 986 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFAND4Q86XD8 727 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHC2Q8IXK0 858 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPICE1Q8N0Z3 855 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR13J1Q8NGT2 312 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8K5Q8NH50 307 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1L3Q8NH93 324 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHOXF1Q8NHV9 184 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSDMBQ8TAX9 411 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPC4APQ8TEL6 797 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP45Q92619 1136 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM104AQ969W3 186 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF1BPQ96EK5 621 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PERPQ96FX8 193 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HARBI1Q96MB7 349 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM68Q96MH6 324 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTRCQ99895 268 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAGR1Q9BTK6 254 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HGH1Q9BTY7 390 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STRA6Q9BX79 667 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM39BQ9GZU3 492 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S1PR5Q9H228 398 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDFQ9HBH1 243 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCND2Q9NZV8 630 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL17CQ9P0M4 197 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAGLN3Q9UI15 199 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa0.59□□□□□ -2.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIVEP2P31629 2446 aa0.59□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARID1AO14497 2285 aa0.59□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC105371242A0A075B767 164 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HAT1O14929 419 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GUCY1B2O75343 617 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VENTXO95231 258 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POP4O95707 220 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RENP00797 406 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VTNP04004 478 aa0.58□□□□□ -2.32
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PROS1P07225 676 aa0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms