RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LYSMD4Q5XG99 296 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF534Q76KX8 674 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM139Q8IV31 216 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEP97Q8IW35 865 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PHC2Q8IXK0 858 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NIPA2Q8N8Q9 360 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q8N9L7 120 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAPK15Q8TD08 544 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPP4R1Q8TF05 950 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF138Q8WVD3 245 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CALML4Q96GE6 196 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHL15Q96M94 604 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RMDN3Q96TC7 470 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIFC3Q9BVG8 833 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IKZF5Q9H5V7 419 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIF9Q9HAQ2 790 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC6A13Q9NSD5 602 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADAM22Q9P0K1 906 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF319Q9P2F9 582 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SUFUQ9UMX1 484 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRIM49BA6NDI0 452 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TFECO14948 347 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATP2A1O14983 1001 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZBTB43O43298 467 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DFNA5O60443 496 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BCL10O95999 233 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RENP00797 406 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TK1P04183 234 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM200BP0CF97 657 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SELEP16581 610 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADD2P35612 726 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GCNT1Q02742 428 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PHLDA2Q53GA4 152 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPECC1Q5M775 1068 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLC3Q6P597 504 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRLQ86TD4 932 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HSCBQ8IWL3 235 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 USP38Q8NB14 1042 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR1L3Q8NH93 324 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AFAP1L1Q8TED9 768 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RUBCNQ92622 972 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NSMAFQ92636 917 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RADILQ96JH8 1075 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EGLN2Q96KS0 407 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LGMNQ99538 433 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 H2AFJQ9BTM1 129 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 THAP2Q9H0W7 228 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 S1PR5Q9H228 398 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLEC5AQ9NY25 188 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TSPYL4Q9UJ04 414 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FEM1BQ9UK73 627 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLK12Q9UKR0 248 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYO16Q9Y6X6 1858 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1W2PRB8 838 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 USP17L23D6RBM5 183 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 E9PAM4 449 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPIPB9F8W1W9 429 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AVILO75366 819 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 H1F0P07305 194 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IRF1P10914 325 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDAP32320 146 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NEK3P51956 506 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LBX1P52954 281 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AK2P54819 239 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPIAP62937 165 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GUCY2DQ02846 1103 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ITPK1Q13572 414 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF146Q15072 292 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF805Q5CZA5 627 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TFDP3Q5H9I0 405 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OLFML2AQ68BL7 652 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRT39Q6A163 491 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL31Q6EBC2 164 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF544Q6NX49 715 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PGBD2Q6P3X8 592 aa0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms