RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	RNF128	Q8TEB7	428 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ATL1	Q8WXF7	558 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ABHD8	Q96I13	439 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	IL17F	Q96PD4	163 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	DUX5	Q96PT3	197 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SPAG5	Q96R06	1193 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	MGME1	Q9BQP7	344 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	EBF2	Q9HAK2	575 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	MYNN	Q9NPC7	610 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425		A0A1W2PPQ1	181 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PRSS44	E7EML9	344 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PTGES	O14684	152 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SMIM18	P0DKX4	95 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PDGFRA	P16234	1089 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PRKCI	P41743	596 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CAPZA1	P52907	286 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	LIMK1	P53667	647 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	MAPK12	P53778	367 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	RBP5	P82980	135 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	BFSP1	Q12934	665 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	KEAP1	Q14145	624 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF585B	Q52M93	769 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PET117	Q6UWS5	81 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	GLRX5	Q86SX6	157 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SPATA20	Q8TB22	786 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	EXT2	Q93063	718 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	FEV	Q99581	238 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	FZD8	Q9H461	694 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	FKRP	Q9H9S5	495 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PELI2	Q9HAT8	420 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CD93	Q9NPY3	652 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	NME7	Q9Y5B8	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CLDN4	O14493	209 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SYNGR3	O43761	229 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ACSL3	O95573	720 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PTPN3	P26045	913 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	HOXC8	P31273	242 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	HOXC13	P31276	330 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	FMO5	P49326	533 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	BMX	P51813	675 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	THOP1	P52888	689 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	DMPK	Q09013	629 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	COASY	Q13057	564 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTC21B-208	ENST00000497425	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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