RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KCNJ9Q92806 393 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GATA6Q92908 595 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RMDN2Q96LZ7 410 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GALPQ9UBC7 116 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DKK4Q9UBT3 224 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 POLG2Q9UHN1 485 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MED16Q9Y2X0 877 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa5.24□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ESYT3A0FGR9 886 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FAM159BA6NKW6 160 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 E5RI56 91 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MATN2O00339 956 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KDM1AO60341 852 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 NIPSNAP2O75323 286 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SPAG6O75602 509 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 C1orf105O95561 183 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RPN2P04844 631 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PROS1P07225 676 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TPBGLP0DKB5 382 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MPC1LP0DKB6 136 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 THRAP10827 490 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ITGB6P18564 788 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CSF2RBP32927 897 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MAPK9P45984 424 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PREPP48147 710 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LSSP48449 732 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MPP1Q00013 466 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ABRQ12979 859 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CUL1Q13616 776 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KRT33BQ14525 404 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TMED2Q15363 201 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KYNUQ16719 465 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TTLL9Q3SXZ7 439 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 AMZ1Q400G9 498 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MAP9Q49MG5 647 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SYTL3Q4VX76 610 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 UNC5DQ6UXZ4 953 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LSMEM2Q8N112 164 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CARFQ8N187 725 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZBTB2Q8N680 514 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MAGEC3Q8TD91 643 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 NCSTNQ92542 709 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CDKL2Q92772 493 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 INPP5DQ92835 1189 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CFAP36Q96G28 342 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 C9orf72Q96LT7 481 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FMO2Q99518 471 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLC30A3Q99726 388 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CMKLR1Q99788 373 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CPNE1Q99829 537 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MENTQ9BUN1 341 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FUT8Q9BYC5 575 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 STRADBQ9C0K7 418 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms