RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 DESI2Q9BSY9 194 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MALT1Q9UDY8 824 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 POLLQ9UGP5 575 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ENO4A6NNW6 628 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf47A7E2U8 309 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV2-70P01814 119 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CDH1P12830 882 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 LHX1P48742 406 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 UGCGQ16739 394 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 KIF19Q2TAC6 998 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SHEQ5VZ18 495 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 FAM171BQ6P995 826 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC107Q8WV48 283 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 NEUROG1Q92886 237 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 INPP5KQ9BT40 448 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 FN3KQ9H479 309 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 EBF2Q9HAK2 575 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MOCS3O95396 460 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ADRA2CP18825 462 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CYP11B2P19099 503 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN3P26045 913 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 PRKCIP41743 596 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK12P53778 367 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 KIF5AQ12840 1032 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 E2F5Q15329 346 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 RNF128Q8TEB7 428 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CORO2AQ92828 525 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 DHX58Q96C10 678 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 LINGO1Q96FE5 620 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SGK494Q96LW2 274 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CSTL1Q9H114 145 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL1Q9NR64 748 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CKMT2P17540 419 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TUBB4BP68371 445 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB17Q13105 803 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PRKAA1Q13131 559 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CUL3Q13618 768 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 VOPP1Q96AW1 172 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 INTS14Q96SY0 518 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SERINC1Q9NRX5 453 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 RNF150Q9ULK6 438 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CTAGE9A4FU28 777 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ASPDHA6ND91 283 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 H0YAE9 185 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 AP5Z1O43299 807 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 NGFRP08138 427 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G4BP0C869 781 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRC-212ENST00000491302 CD22P20273 847 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CBLP22681 906 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 MPZP25189 248 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 DSCR9P59020 149 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 GAGE5Q13069 117 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRC-212ENST00000491302 MFAP5Q13361 173 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TCTE1Q5JU00 501 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 NUP93Q8N1F7 819 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF479Q96JC4 524 aa7.26□□□□□ -1.25
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