RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488741.5

CREM-238, Transcript of cAMP responsive element modulator, human

TSL 2 BASIC

Gene CREM, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREM-238	ENST00000488741	CLCN3	P51790	818 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PLK1	P53350	603 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	OR4D2	P58180	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	GNG2	P59768	71 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	COPZ1	P61923	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	SLC35A2	P78381	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	IL5RA	Q01344	420 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	LCP2	Q13094	533 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	POU6F1	Q14863	301 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CDK10	Q15131	360 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	MAPK11	Q15759	364 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	NPTX1	Q15818	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ZBTB6	Q15916	424 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	SMU1	Q2TAY7	513 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	FUT11	Q495W5	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	SV2C	Q496J9	727 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	XKR7	Q5GH72	579 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	NPW	Q8N729	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ARL10	Q8N8L6	244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	IPMK	Q8NFU5	416 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	NDNF	Q8TB73	568 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	SLC38A4	Q969I6	547 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	LGALS12	Q96DT0	336 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ZNF599	Q96NL3	588 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ITPA	Q9BY32	194 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ALG9	Q9H6U8	611 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PIGV	Q9NUD9	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	FNIP2	Q9P278	1114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	OPTC	Q9UBM4	332 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CDH9	Q9ULB4	789 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	BTRC	Q9Y297	605 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	NME7	Q9Y5B8	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CIT	O14578	2027 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	OR2A25	A4D2G3	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CENPX	A8MT69	81 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PTGES3L	E9PB15	166 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	FAM72C	H0Y354	149 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	WNT10B	O00744	389 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TBX1	O43435	398 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	HS6ST1	O60243	411 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	TSPAN1	O60635	241 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	KERA	O60938	352 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	FAM20B	O75063	409 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	GUCY1B2	O75343	617 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ZBTB7A	O95365	584 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	MT-ND2	P03891	347 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	MMP10	P09238	476 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	LINC00032	P0C843	101 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	ARSA	P15289	507 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	CD36	P16671	472 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CREM-238	ENST00000488741	M6PR	P20645	277 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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