RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485060.1

PIK3CB-211, Transcript of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PIK3CB, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3CB-211	ENST00000485060	FUT6	P51993	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	EGR4	Q05215	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	KLC3	Q6P597	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	TTC14	Q96N46	770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	HYKK	A2RU49	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	OAZ2	O95190	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	NTN1	O95631	604 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	TFAP2A	P05549	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CD22	P20273	847 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	UBASH3A	P57075	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	DSCR9	P59020	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	DMPK	Q09013	629 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	TRAF2	Q12933	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	BFSP1	Q12934	665 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SNTA1	Q13424	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	NR1D2	Q14995	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CPNE1	Q99829	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	KDM5C	P41229	1560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060		H0Y626	953 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	TSPAN1	O60635	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	BMP15	O95972	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	HOXC13	P31276	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	MTHFR	P42898	656 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ZNF75D	P51815	510 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	THOP1	P52888	689 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	MAPK12	P53778	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3CB-211	ENST00000485060	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms